就在国民党阵营出招挺马之际，苏贞昌领导的“行政院”在11月29日对“国务机要费”和“特别费案”方面做出了有利于马英九脱困的界定，令外界“大跌眼镜”。当天，台湾“法务部长”施茂林在“行政院院会”上指出，“特别费”已形成行政惯例，具有对“行政首长”有“实质补贴”性质，因此相关支出“难以截然划分公私”。如果告来告去，问题将十分严重，争议将无止息，且一时间要追查多年前的旧账，“并不合理”。“行政院长”苏贞昌也表达相似的看法认为，解决问题不能靠清算斗争、恶意株连，应由各方共同合作，跨越历史面向未来。不过，“行政院”的动作立即招来民进党内骂声一片。有民进党高层表示，“行政院”早就应该出面把话讲清楚，苏贞昌此举“在特别费上是心虚”，是官官相护的官场恶习。苏贞昌的动作，到底是想为马英九解套？还是为扁马解套？还是为自己？