据媒体报道，马英九表示两岸经济合作架构协议非政治性，也不会涉及“统独”问题，未来会举办座谈会集思广益。而且，事前一定会让大家知道将来会去签什么，但至于内容部分，如果要对双方都有拘束力，一定要对方同意才行。他强调，在和大陆谈判，签署有关经济的协议，不是只为大陆，而是全球布局的一部分，这非常重要，“今天不做，明天就后悔”。面对两岸关系回暖，民进党发起呛马游行，大陆台湾问题专家就此评论：“两岸对话，民进党情绪失常”。