陈水扁中美洲之行被视为“谢幕演出”、“最差待遇出访”。在过境美国阿拉斯加时，他都没下飞机，据说这是在向美方表达无声抗议。然而，美方对陈水扁一行的闹腾根本不予理睬。陈水扁在中美洲“友邦”于洪都拉斯签署“联合公报”，尽管台方大方承诺将给予该地区多项援助，不过，原本台湾所提支持入联主张，最后却未如愿纳入“联合公报”中。